同学您好，A公司与B公司因业务原因需红冲已抵扣发票时，确实可以通过开具红字发票来进行处理。具体操作步骤如下：首先，A公司应与B公司取得联系，确认红冲原因并征得同意。随后，A公司准备相关证明材料，并向税务部门提交红冲申请。税务部门审核通过后，A公司可开具红字发票，并将其交付给B公司。B公司在收到红字发票后，需及时进行相应的账务处理。具体来说，B公司应借记“原材料”（红字）和“应交税费——应交增值税（进项税额）”（红字），同时贷记“应付账款”（红字）。