如果在税扣缴端由于未扣减相关费用而导致多扣了个人所得税，且已经更正申报，可以按照以下步骤申请退还多扣的个人所得税税款： 登录自然人电子税务局（扣缴端）：首先，通过输入账号及密码登录到自然人电子税务局（扣缴端）。 进入退税申请页面：在登录后的系统中，找到并点击“退付手续费核对”功能。阅读并确认相关信息后，可以查看和核对单户核对清册。 提交退税申请：在核对清册无误后，按照系统提示，提交退税申请。确保提供的信息准确无误，以便税务部门能够准确处理退税请求。 查询退税状态：提交退税申请后，您可以通过自然人电子税务局（扣缴端）查询退税申请的当前状态。如果有需要，还可以进行切换查看多笔结报单的状态。