电子数据外管证注销可以通过电子税务局进行。具体流程如下： 登录电子税务局：首先，需要登录电子税务局，选择需要核销的外管证编号，并确保登录的用户信息是法人的办税人员信息，以便接收验证码。 选择套餐业务：在电子税务局中，选择跨区域涉税事项套餐。 填写纳税人信息：在“经营地涉税事项反馈-外出经营情况”中填写相关信息，包括预缴税款信息，核对无误后提交。 核销外管证：成功核销外管证后，系统会显示“报告已反馈”。