如果公司给个人开了普票，但对方部分款项转入公司账户，大部分转入老板个人卡，可以考虑以下方式做账： 确认收入：将转入公司账户的款项确认为公司收入，并开票给对方。 记录往来：对于转入老板个人卡的款项，可作为公司与老板个人之间的往来款进行处理，并记录相关账目。 确保合规：需确保整个交易符合相关法律法规和公司财务制度的规定，避免潜在风险。