对于沈阳公司的员工是残疾人，且已经通过残联备案的情况，如果需要进行系统备案，可以按照以下步骤进行操作： 1.登录系统：首先，确保公司已经注册并登录到相关的系统或平台。这可能是残联或相关部门的在线系统，也可能是一个内部的管理系统。 2.填写备案信息：在系统中，找到员工残疾备案的相关部分。根据系统的要求，填写员工的个人信息、残疾类型、残疾等级、残疾证号码等必要信息。确保填写准确无误，并附上员工的残疾证复印件或其他相关证明材料。 3.提交申请：完成填写后，提交备案申请。根据系统的提示，选择提交方式（如在线提交、邮寄等），并按照要求完成提交。 4.等待审核：提交申请后，等待相关部门的审核。审核过程可能包括人工审核或系统自动审核。根据审核结果，可能需要补充材料或修改信息。 5.完成备案：如果审核通过，系统将完成备案流程。员工的残疾情况将被记录在系统中，并可用于后续的管理和查询。