同学您好，企业在注销清算时，应当依法缴清各类税款，对于还有留抵税额的情况，可以按照以下步骤进行处理： 提交注销申请：企业应当向税务机关提交注销申请，并附上留抵税额的相关资料。 税务机关审核：税务机关会根据企业提交的资料进行审核，确认留抵税额的数额和真实性。 退还留抵税额：如果企业确实存在留抵税额，且符合相关规定，税务机关会退还留抵税额给企业。