在经营所得个税中实现扣除专项附加扣除，可以按照以下步骤操作： 1.准备材料：需要准备个人独资企业经营者张三的身份证、个人所得税APP账号密码、个人独资企业营业执照等相关材料。 2.登录个人所得税APP：打开个人所得税APP，使用张三的身份证和APP账号密码登录。 3.进入申报界面：在个人所得税APP中，选择“申报专项附加扣除”选项，进入专项附加扣除申报界面。 4.填写信息：在专项附加扣除申报界面中，填写子女教育、赡养老人等专项附加扣除的相关信息，并确认无误后提交。 5.提交申请：在提交申请前，需要确认专项附加扣除的金额是否正确，并选择申报方式为“综合所得年度自行申报”，然后提交申请即可。 需要注意的是，如果张三同时又是另外一家企业的员工，需要先在另外一家企业中申报工资薪金个税，然后再按照以上步骤实现经营所得个税中扣除专项附加扣除的操作。