您好，可以扣除的 根据《个人所得税法》第六条规定，应纳税所得额的计算:(一)居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。 本条第一款第一项规定的专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等;专项附加扣除，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报全国人民代表大会常务委员会备案。 按着税法规定，可以按着实缴的金额，据实扣除。因为灵活就业人员缴纳的社保也是按着国家的规定去缴纳，且无需区分个人和单位部分。此规定也适用经营所得个税扣除。