1、 注册为系统用户：由于海关总署每天都需要审核很多的文件，而为了减少海关备案的时间和提高海关工作人员的效率，海关备案流程首先要做的就是在海关保护备案申请系统上注册系统用户，填写基本信息和获取相关的账号和密码。 　　2、 接着海关备案流程就是在系统上备案的相关申请数据和必要的相关信息，并且及时地缴纳备案所需要的费用。但是在汇款的时候务必要注明备案申请编号。一般而言，每项备案都是800元。 　　3、 在海关备案流程里面，除了要在网上填写相关的申请信息之外，还需要将这些申请信息和数据打印出来，并且盖上申请人或代理人的印章。之后还需要将这些纸质的文件和汇款凭据等文件回到海关总署。 　　4、 当海关总署受到纸面申请之后才会真正开始步入海关备案流程中的审核阶段。在这段审核过程中，申请人可以在系统上了解海关总署的审核的整个过程，并且可以根据海关总署的申请意见及时地进行修正。 　　5、 海关总署在受到申请人的海关备案文件的30天之内就会对申请作出核准和驳回申请，并且会向申请人发出书面通知。但是如果备案被驳回，海关总署是不退还申请文件的，所以申请人最好自己备份申请的文件。