通行费发票税率一般常见的有三档：3%、5%、9%。道路的性质不同税率就会不一样，公路通行的简易征收的税率是 3%。如果不选择简易征收，经营公路通行业务，属于不动产经营租赁，正常适用税率为 9%。 规定： 《营业税改征增值税试点实施办法》（财税[2016]36号） 车辆停放服务、道路通行服务（包括过路费、过桥费、过闸费等）等按照不动产经营租赁服务缴纳增值税。 《关于租入固定资产进项税额抵扣等增值税政策的通知》（财税【2017】90号） 文件第七条规定，不同道路类型的通行费发票抵扣税率不同。支付的道路、桥、闸通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税抵扣进项税额： 1.高速公路通行费可抵扣的进项税额=高速公路通行费发票上注明的金额÷(1+3%)×3% 2.一级公路、二级公路以及桥、闸通行费可抵扣的进项税额=一级公路、二级公路、桥、闸通行费发票上注明的金额÷(1+5%)×5%。 根据财税【2016】36号文附件一第十五条 、财税【2018】32号文、税务总局2019年第39 号公告规定： 增值税税率：（二）提供交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，税率为 9%。