专属管辖与协议管辖有着密切的关系。专属管辖构成了对协议管辖的限制和排除。凡属专属管辖的案件，当事人不得以协议管辖的方式予以变更，这是世界各国的通例。正是由于专属管辖与协议管辖有着紧密的联系，因此常常需要通过协议管辖来解释、说明专属管辖。例如，德国的尧厄尼希教授在其主编的教科书中对专属管辖所下的定义是：“某法院的专属管辖是指这种管辖不能通过当事人协议或者无责问地对主诉辩论而变更，并且应当在权利争议的任何状态依职权注意之”。 　　需要说明的是，当协议管辖只选择某一个法院管辖时，该案件只属于当事人选定的那个法院管辖，其他法院无权管辖，这使得协议管辖也具有一定的专属性，或者说通过协议使案件“专属”于某一法院管辖，但是，这并不是真正的专属管辖，并不具有专属管辖的效力。例如，在双方当事人选定合同签订地的甲地法院为管辖法院后，如果当事人一方在发生纠纷后却向合同标的物所在的乙地法院提起诉讼，而另一方当事人也应诉答辩了，那么当事人双方在事后就不能再以存在着“约定的专属管辖”为理由而提出管辖异议。