作废申报与更正申报的区别主要在于操作后的效果，对于作废申报，企业申请作废申报后，已经没有数据了，过期了仍未申报，则要按未申报来处理，更正申报则在操作后，申报数据仍然存在，不会按未申报来处理。纳税人、缴费人、扣缴义务人办理纳税申报后，发现申报表存在错误，完成修改更正或作废。申报错误更正时除个人所得税只能全量更正或者申报作废，不允许差额更正或补充申报。