缴纳土地使用税时，应按已交付面积扣减。这是因为交付内容就是土地使用权；另外，从省地税法、国土法和依据双方签订的合同的角度考虑，也不允许把交付金额按开具的发票面积缴纳土地使用税。 拓展知识：土地使用税是我国落实土地承包制的重要财政税种，是地方政府收取的土地使用权的税。根据有关财政及土地税收法规规定，缴纳土地使用税应当按照实际使用面积计税。