当企业注册资本超过500万应实缴资本时，企业可能面临一系列的税收问题，包括企业所得税、个人所得税和增值税等。此外，企业还需要增加管理团队和市场营销团队，以确保能够获得一个良好的扩张和发展。而超出500万的入资都做资本公积，将有利于企业的发展，它不能被派发给股东，只能用于补充公司负债，或者以现金形式注入公司，用于发展新的项目和投资，从而实现企业的长期发展。 例如，一家企业注册资本为500万，但是实际实缴资本为1000万，则公司可以将剩余500万作为资本公积，利用这些公积金可以补充公司经营负债，并用于购置生产设备或购买新的技术，从而提高公司的生产经营效率，实现公司的长远发展。