是的，库存商品盘亏计入营业外支出，会影响企业的增值税纳税义务。库存盘亏的支出属于营业外支出，不影响企业的主营业务收入，因此不计算在企业应税收入之内。如果企业的应税收入减去盘亏损失的话，可以有效的降低企业纳税负担。但是，当企业减免应税收入的同时，也要注意监管部门对营业外支出的监管与管理。营业外支出必须合规，企业应做好全部凭证保留和查询工作，以备税务部门专查时能够证明营业外支出符合国家税收法律和规定。