首先，在处理房产中介公司加盟其他品牌的账目时，需要先确定已收到的货款和品牌费的金额。其次，根据比例支付品牌费的协议，在收到货款时直接抵扣了品牌费，则应该将应收的货款收入与品牌费发票的金额进行核对，如果金额相同，则可以将货款收入在应收账户上登记，并从品牌费支出中记账，品牌费发票只需要作为财务凭证存档。最后，如果品牌费发票是直属公司的发票，则需要登记账户，如：应付账款-直属公司，将直属公司发票对应的品牌费分账到该账户中，做到品牌费的记账和付款。 案例： 某房产中介公司与外部品牌之间签订了一份协议，按销售收入的5%支付品牌费。在收到客户货款1000元后，直接抵扣了品牌费50元。最后，某房产中介公司收到了直属公司的发票，其中，品牌费发票金额为50元。因此，该房产中介公司应把货款1000元在应收账上登记，将品牌费发票金额50元分账到应付账款-直属公司账户，并上传其付款凭证，完成品牌费的记账和付款。