税务稽查补申报后账务处理是指税务稽查过程中发现企业未申报或少申报税款，对应企业需要尽快补申报税款，以避免被追缴未申报税款及相关处罚。税务稽查补申报后账务处理包括金额计算、预缴税款入账或税款退回、补申报审核及复核税款入账、利息计算及税务稽查补申报处理的记账处理等等一系列的流程。 例如，某公司在税务稽查过程中发现，该公司实际上用于研发的科研费用与其报税表面上计算的科研费用有所出入，未申报的科研税款总额为50万元。此时，该公司需要将50万元的科研税款补申报并进行账务处理，同时要付出一定利息，该利息按照公司实际欠税天数计算，缴纳至财政机关。