农产品收购发票可以凭借开具相关票据抵扣进项税额。抵扣方式有以下几种： （1）当月发票进项税抵扣：可以根据销售商按照规定开具的正确发票，把农产品收购发票上的进项税抵扣在当月纳税申报表中； （2）累计抵扣：可以把农产品收购发票上的进项税累计抵扣，若抵扣不够本月的应纳税额，可以把剩余部分累计到下月申报，不影响本月纳税申报。 （3）财政政策补助：一些地区也可以根据财政政策补助，把农产品收购发票上的进项税抵扣部分由政府补贴，由企业取得。 总之，农产品收购发票进项税可以抵扣，需要按照规定和财政政策进行申报，保证抵扣真实性，确保纳税正确有效。