事业单位结余及其分配的会计核算主要分为以下几个步骤： 一、确定结余：首先需要确定当前存在的结余，通过财务报表的发布可以获得，结余由上年度的最终结转结余和本年度经营收支分录所确定。 二、调整结余：针对发现的结余，要进行相应的调整，如处理与现金收支有关的调整，再有其他无形资产的收支及损耗盘损。 三、确定结余分配比例：根据结余的大小确定本年度结余分配比例，在不超出事业单位法定规定的前提下，结余必须同时均衡经济效益与社会效益，并让政府收益最大化。 四、存入国库：将确定的结余分配比例中的政府收益存入国家财政，并生成国库收支凭证，以计入会计账簿。 五、进行核算：对分配给其他部门的收益进行准确计算，进行资金核算，记录资金实收，同时制作相关符合会计准则的证明文件。 拓展知识：事业单位结余强调改善会计管理，把握财务状况，制定科学合理的收支比率，完善财务报表，让各种收支资金有效发挥作用，从而促进事业的发展和改善经济社会的状况。