第三季度申报后税局系统显示营业收入和营业成本都是负数可能是由于四大账户余额数据统计而产生的虚拟负值，余额计入新季度预算时，它们需要反映出上季度以及累计到当前季度的累计成本。因此，它们会显示为负值，但也不影响财务报表的准确性和当前的财务状况。此外，由于该季度的实际收入或成本记录可能不够精确，也可能导致负值出现，这也是比较常见的情况。拓展知识：账户余额计入当前季度预算时，它们需要反映出上一季度以及累计到当前季度的累计成本，这使得余额有可能会显示为负值，但不影响财务报表的准确性和财务状况的真实性。