处理这些余额首先要查看累计销项税和进项税的明细情况，以确定是否存在税收违法行为。接着，采用税务管理程序，凭借现行税法和税务程序，对已计算的税金累计金额进行进一步核实，根据核实情况，分别做出减免税申报、补缴税款或者支付费用的处理。同时，严格按照税务程序进行审核，对未缴税款的税负进行完善，以保证税收核算充分科学、准确合法。 此外，在处理税款累计余额时，可以通过预提扣除和税收减免等会计处理控制税款累计余额，并可以采用折旧合并方法，分担企业在一定时期内的税收负担；通过税金的节税递延期可以较好地缓解企业的税收负担，有效地防止税金累计余额的产生。