是的，在公司注销的情况下，应付款的余额将被视为企业收入，由税务局监管，计算其应纳税额，并由公司向税务局支付。根据《中华人民共和国企业所得税法》，税收机关按照税率预先估算企业全年应纳税额，按月收税。例如，某公司在关闭时拥有一定金额的余额，其月应纳税额可由税务机关按照单位所得税定期缴付比例计算得出。 此外，《关于公司注销后企业所得税征收办法（试行）》明确了公司注销后企业所得税的征收办法，包括：（1）企业报告税收登记信息。（2）税收机关核算企业最后一个财务期的应纳税额，核定企业应收的企业所得税。（3）报还此前发生的一般纳税义务。（4）报送最后一个财务期企业所得税收入和支出。 总之，企业应付款余额属于企业收入，应被收税。税务部门会按照相关法规收取和监管企业所得税，严格执行税法，保证企业按期缴纳税款，健全企业税收管理制度，促进社会经济健康发展。