补发员工工资的账务处理要根据员工补发工资的原因，按照不同的方式处理。 1、如果是因为未发出或发出多发，应当从工资费用科目里面补偿支出，再从应发账户借账，贷工资发放科目，平衡账务； 2、如果是由于工资调整，应当从应付账户借账，从工资调整费用科目里面贷账，再从应发账户贷账，贷工资发放科目，使账不平衡，平衡账务； 3、如果是由于工资年终奖的调整，则可以从应付账户借账，从工资调整费用科目贷账，再从应发账户贷账，贷工资发放科目，使账不平衡，平衡账务； 4、如果是由于加班工资的发放，可以从应付账户借账，从加班工资科目贷账，再从应发账户贷账，贷工资发放科目，使账不平衡，平衡账务。 拓展知识：补发员工工资时，一般会在会计处理中用补差费用来抵消应发工资，从而实现实物交换和会计平衡，这种补偿方式被称为费用抵扣，是根据会计原则和会计准则进行计算和调整的一种财务处理方式。