处理这种情况，首先要确定有没有违法行为，如果没有，那么企业需要将以前没有报个税的员工工资重新缴纳个税,个税费用可以在纳税申报时进行财务核算，否则就有可能被国税局追收。 如果有违法行为，则由当地税务机构处理。违反个人所得税法的，由主管税务机关责令限期改正，并处以罚款。 拓展知识： 近年来，国家逐步加大了对个税的管理力度，要求企业落实个税相关责任，要求企业严格依法履行个人所得税的纳税义务，确保有效收缴。企业需要完善管理制度，准确计算和及时申报个税，保证员工合法权益。