民间非营利组织会计制度中，在3月支付2021年的清洁费，应当以开票日期为准，进行入账。具体操作步骤如下： 1.登记当月支付的清洁费：根据发票，在当月支付费用分录中，登记与清洁费有关的支出额，并依据应付账款科目登记清洁费的应付账款； 2.登记清洁费的贷方：清洁费的贷方应当在管理经费科目中登记； 3.登记应付清洁费的期限：在登记应付账款时，应当注明支付清洁费的期限，方便财务部门能及时跟踪清洁费的付款情况； 4.登记清洁费收受方：在登记应付账款时，还应依据发票，把清洁费收受方明确； 5.登记清洁费是否付清：付款情况也应当在登记应付账款时，一同登记。 以上就是民间非营利组织会计制度中，在3月支付2021年的清洁费，应当如何进行入账。拓展知识：会计原则规定，所有应付账款，都应当在登记时，明确支付的期限，以及应付账款的收受方。以此严格控制应付账款的支出，以免出现财务资金的浪费。