在处理9月计提与10月实际扣税不一致的问题时，首先应该完成税费清算，其次编制账务分录。税费清算方面，应先确定9月计提税金是否全部归还，以及10月应当纳税及扣税是否在时效内完成，并全部纳税。对于账务分录，要根据实际情况编制，譬如9月应计提税金多于实际应纳税额，则可以在当期网上申报税费清算时，发生一张借方名目为“本期税金及附加贷方”的账务分录，科目编码为6002，借方金额为9月计提税金，贷方金额为实际10月应纳税额；对于10月应纳税额多于实际纳税额，则可以按正常项目分录，借方金额为月应纳税额，贷方金额为实际纳税额，同时可以在备注中特别注明“9月计提税金税金及附加”。 拓展知识：税费清算是指纳税人根据相关法律法规，按照定期和不定期的频率，清零其未完成的税费收入（税款）及适用的附加税、滞纳金等。税金清算的原则是企业纳税人根据实际情况，以实际支付的税款与其相应的应纳税额之间的差额来进行清算。它是企业纳税人自身遵守法律义务，实行税收管理的一项重要举措。