如果你的公司有一笔保证金，交款时是转到分公司，而对方想从总公司退回，那么可以尝试退回。但是，一般来说，转出方一般会有转账凭据（如支票），退款方应持有转账凭据，或者需要准备符合保证金退回的文件和证件。如果两方都有转账凭据，那么可以直接对账退款，而无需做其他的手续。如果在退款的过程中出现问题，可以采取以下几种方式解决：一是经过调解，两方达成一致意见，由转出方支付保证金；二是提供有效的凭据，一方支付保证金；三是进行符合保险机构或者其他合法第三方机构的仲裁，划分利索和责任，最终对账成功。总之，如果遇到退回保证金纠纷，可以采取上述几种方式解决，保持双方利益最大化。