纳税人在物流行业中需要申报的主要税种包括增值税、消费税和营业税。 增值税是指进口物品或者其他货物或服务的税收，消费税是指消费者从购买商品或者服务中所支付的税收。营业税是指物流行业提供正常经营业务服务而需要交纳的税收。 纳税人物流行业还需申报其他较少见的税种，如印花税、资源税和土地增值税等。印花税是对有价证券及证券账户的税收，资源税是指矿产、石油、天然气等资源的税收，土地增值税是指土地经由加工后受益的税收。 以上是纳税人物流行业需要申报的税种，当纳税人实施税收筹划时，最好是以一种有序的方式来申报，以免出现重复纳税和缴纳税收的问题，减少税收负担。此外，纳税人必须遵守当地相关法律法规，尤其是纳税义务，才能保证正常经营及按时缴纳税收。