处理这种情况，首先要确定去年的申报是否有异常，在此之前，应检查最近一年的发票是否全部入账，检查销售发票是否有归类错误，以确保发票是否存在出现重复入账的情况。 在确定去年发票是否有异常之后，可对比去年财务报表及实际情况，综合确定当前应交税费。按照实际情况，无论发票是否全部入账，都应在税管机关汇算清缴税款，准备好有关税务文件及信息，按规定的税种、税率及期限向税务机关申报，并缴纳汇总清缴的税款。 此外，应完善内部管理制度，落实每月发票入账、成本和报税工作，减少未入账发票和报税错误等情况出现。期间，可定期使用报税软件，以及使用财务报表管理软件追踪税务工作，从而有效落实及时报税和入账的相关工作要求。