如果银行有两笔款进账，而没有开具发票，可以根据收款单约定的条款，就其所提供的证据，凭借其双方的实际行为，给出符合法律规定的证据，进行事实性的认定；同时，根据收据上的内容，形成法律文书，并签字确定，以免可能产生纠纷。证据可以是收款单、发票、双方签订的协议，也可以是其他可以证明货款来源的材料，这些文件都是健全合理的审计和财务管理中不可缺少的组成部分。同时，也可以通过询问双方关系人或其他有关人员，以及查询企业账户系统，记载发生的交易，收集可以证明财务情况的证据，有助于实现财务管理的透明化。拓展知识：对企业及其它免税单位、单位交易，结算时发票明细与结算金额不符，应当采取收支实收实付原则，按实收实付价格进行结算，同时双方应交易财务凭证，开具正确的发票；及时开具正确的发票有助于完善企业的财务体系，避免产生相关的税务或其他问题。