答：该商业企业第三季度的应纳税额为17088.00元。 具体计算如下： 1.销售给某小型超市一批肥皂,销售收入206000元：应纳税额为206000*3%=6180.00元。 2.将本季所购化妆品销售给消费者,销售收入41200元：应纳税额为41200*3%=1236.00元。 3.销售给某制造企业货物一批,取得销货款3万元,由税务机关代开增值税专用发票：应纳税额为30000*17%=5100.00元。 4.提供给个人消费者餐饮服务,取得销售收入144200元：应纳税额为144200*5％=7208.00元 因此，该商业企业第三季度的应纳税额为6180.00+1236.00+5100.00+7208.00=17088.00元。 小规模纳税人以一般计税方式纳税时，可以参照现行有效的税收优惠政策，按照适用法律，根据销售额不同，适用不同税率，如果销售额低于或等于50万元，适用3％的税率；如果销售额高于50万元，则按照17％的税率计算。 拓展知识：税收优惠政策是指政府采取措施减轻税负，改善企业投资环境、激发企业发展活力、促进社会经济增长的一系列政策性措施。它可以从减税、免税、税速率和征税政策四个方面去实施，实现企业负担减轻的目的。此外，税收优惠政策也是政府改革制度的重要措施，既可以为企业创造有利环境又能使企业负担减轻。