甲方在签订完门窗工程合同之后，应该支付预付款，乙方则需要给甲方开具特票或专票，并做出相关账务处理。特票或专票应该包括合同双方信息、涉及商品明细、金额等内容。甲方在支付预付款之后，应该留有相应的收据，并在其财务报表中进行相应处理。乙方需要根据实际情况，要判断预付款是否可入账，还是需要留存待用。当然，乙方也需要根据支付的预付款的种类、数量以及实际情况，对相应的库存或者费用进行相应的记账处理。 除此之外，乙方还需要关注预付款的期限、收款银行以及处理超期预付款等问题，以防止预付款被过度使用或者流失。此外，乙方也应该关注发票的开具程序，包括税率、发票号码、开票人等内容，以确保发票的真实有效。最后，乙方在处理上述事宜的同时，也应该遵守《中华人民共和国发票管理办法》的有关规定，以确保相关业务的合规化。 可以拓展的知识：预付款是指付款人在履行合同前，将货款先支付给卖方或服务提供者的一种支付方式。它既可以用于买方支付货款，也可以用于卖方收取货款，具有对卖方提供资金保证作用，也可以起到给买方提供保障作用，减少双方履行合同风险。