代发工资和跨行转入的区别在于资金的流向方式不同，代发工资是指雇主将资金通过银行账户直接支付给雇员，在这种情况下，雇主将资金存入雇员的银行账户中，该账户的所有人是雇员本人。跨行转入是指雇主将资金通过银行账户支付给另一家银行，另一家银行再将该笔资金转入雇员的银行账户中。因此，您的工资是由甲公司发放的，但是你的工资卡是中信银行的，所以，雇主将资金通过交通银行上海分行的转入接口转入您的中信银行银行卡中。 拓展知识：现在，许多企业都采取代发工资的形式，其主要优点是快捷、方便，可以更快地将资金转给雇员；而跨行转入虽然稍有复杂，但是资金到账安全可靠，有利于保护雇员和雇主的权益。