是的，通过自然人代开有shuiju的完税凭证存在一定的风险。首先，政府要求企业的税收一定要按照规定准确申报缴纳，如果公司使用了非正常渠道支出的成本，有可能会受到政府的违规处罚，因为企业应当通过正常渠道付款，不能随意使用税务偷漏税收的行为。另外，在自然人代开有shuiju的完税凭证时，还有可能出现企业款项被坑的情况，当企业付款，代开shuiju的自然人往往有可能拿走企业付款，而不能及时出具完税凭证给企业造成经济损失。 此外，使用自然人代开有shuiju的完税凭证也会影响到企业长期发展，因为企业在实施财务管理和财务报表披露时，如果采用非正常渠道出具完税凭证，可能会影响企业正常管理，影响财务报表披露，使得企业在未来发展中受到不利影响。因此，在使用自然人代开有shuiju的完税凭证时，要多加注意，对自然人的资质和能力要加以审查，防止出现被坑的状况。