员工出差的专票进项可以抵扣的。国家税务总局对专用发票的税收优惠政策或规定指出，在符合规定的情况下，纳税人可以在申报税款时，根据有关政策规定、实际发生的税务义务额及可扣除税款额，减免购货方纳税义务，抵扣购货方纳税义务，并以扣除额减免销货方纳税义务。专用发票可以抵扣的情况包括：1.专用发票购买的货物及服务；2.从海关出口的货物及服务；3.税收进出口关系清算纳税义务；4.特许经营的货物及服务；5.原产于港澳台地区的货物及服务；6.国家规定的其他抵扣等。以上政策规定，说明专用发票进项可以抵扣，也就是说员工出差的专票进项是可以抵扣的。 尽管如此，为了保证税收识别制度的有效运行，纳税人购买货物或服务时，应当遵守规定，出示有效的发票，并确保发票内容真实、完整、准确。