注册会计师在审计期间发现发票金额有误，有可能是客户擅自分账，那么注册会计师应该立即采取有效措施，以确保另一个单位获得它应有的资金。首先，注册会计师应该确定是否有单位擅自分账，并能够识别擅自分账的单位和金额。其次，注册会计师应该向另一个单位提供证据，如审计报告，发票，科目明细，凭证等，以证明被审计单位有欠款。最后，注册会计师还应该根据相关法律法规指导另一个单位如何正确收取欠款。 拓展知识：注册会计师发现审计单位财务问题，通常需要分析客户的审计资料，了解客户的财务状况和客户财务管理工作，并根据实际情况提出审计建议，以帮助客户解决问题。