处理小规模公司遗失的进项发票的步骤如下： 1）第一步，应当向对方出示一份《发票遗失证明》，提供该发票的编号，和发票的相关信息，并签字盖章。 2）第二步，发票遗失后，小规模公司应该在《发票遗失证明》上提供发票的内容，日期，金额等信息，以证明发票内容。 3）第三步，在遗失发票的情况下，小规模公司需要准备两份附表，第一份要编号，把发票内容和当期销售金额汇总；第二份要把发票内容和当期进项金额明细汇总。 4）第四步，最后，小规模公司需要准备一份财务凭证，以证明发票内容和当期的进项金额。 拓展知识：事后发放的发票，只能在该月的进项税额中进行抵消，且仅能抵扣本月发放的发票金额，而不能抵扣上月发放的发票金额。