在这种情况下，应该使用发票认证法入账。首先，在10月份先预付10000元，应当分两条记账：一条是应付账款的借方10000元；一条是现金的贷方10000元。然后在11月付款51543.6，也应当分两条记账：一条是应付账款的贷方51543.6，一条是现金的借方51543.6。最后，当发票开票的时候，本次的发票金额为61543.16，少开0.44元，此时应当按发票认证法办理：首先，以61543.16元为准，借应付账款61543.16元；同时，贷发票销账款61543.16元；最后，当确定发票没有问题后，销发票销账款61543.16元，借应付账款销账款0.44元。 拓展知识：发票认证法是一种受理、认证发票的会计核算方式，其根据发票内容作会计处理，将按照发票数额与合同或实际数额的差额，在未进行处理的情况下，将发票数额作为会计核算的有效数额，以简化会计操作，加强实物采购发票的会计管理。