公司变更股东出资比例和认缴比例未交个税，其潜在的税务风险非常巨大，如果被税务机关发现就可能会进行相应的行政处罚，具体来说就是扣除当年的个缴税税费，同时罚款和滞纳金，同时由于失信风险或影响企业的其他活动，还有可能会面临行政处罚的风险。为了避免这种风险，在交纳税款时，公司应当遵守《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例的规定，准确完整地填写申报表，及时向税务机关申报缴纳，并保证个人所得税的规范合规缴纳。 此外，公司还应对股东出资比例和认缴比例的变更进行合规管理，任何变更的决定必须在相关的履行义务前进行，避免违反法律法规及各类政策规定，否则可能受到严厉的处罚。