是的，可以将工程车上的配件费用作为维修费用。根据《中华人民共和国发票管理条例》第十七条，维修费用可以作为正常经营性支出，开具正规发票。而工程车上买的配件就可作为维修费用开具发票。但要注意，配件可以作为维修费用，但不能作为采购的材料开具材料发票。针对这种涉及费用较高的维修类发票，建议企业可在收到发票后，即时做好现金管理工作，以防出现违约的风险，以免出现财务问题。