公司注销的时候，法人垫资的其他应付款余额应当先用于清偿财务负债，如支付社会保险费、税款、其他应付款项等，以及用于补足受益人的投资损失，最后用于支付给受让人的价款等。如果财务负债已清偿完毕，余下的其他应付款余额应归还法人垫资人作为垫资款，由法人垫资人自行办理相关财务结算手续，完成公司注销程序。 需要注意的是，公司注销时，如果其他应付款余额大于财务负债，则只能支付给受让人的价款，不能消减认缴资本和减少拟补足投资损失的款项，以及其他股东的投资损失。 拓展知识： 从公司角度来讲，法人垫资是一种为公司提供运营资金的重要方式，它尤其适用于那些没有能力融资的中小企业。法人垫资的优点在于，它可以有效补充公司资金短缺、减少银行借款手续和财务负担，可以有效提升公司经营能力和发展速度，也有利于公司降低融资成本、减少投资风险。