代账公司为客户的应付款（自然人股东）处理的首要步骤就是根据该科目的数据，明确款项的缴付时间，流水账记录和付款内容。根据付款的性质，分为两种情况：款项在客户的名下，进行有权记账；款项在代账公司支付，代账公司有责任记账。其中，客户需要准备的材料有：银行流水(有关交易的银行流水)，发票(可根据实际情况提供需要的相关发票)，资金转账单据(提供实际扣划或者资金转账时的单据，比如工资表等等)。 当代账公司收集完所有的材料，并确认账款相符时，就可以申请财政部门的税收发票，税务部门核实后，会将发票开具给代账公司，代账公司确认无误后，就可以根据客户的要求，销掉相应的应付款。 以上就是代账公司给客户做账，销掉其他应付款—自然人股东的处理方法。此外，代账公司还可以根据实际情况，制定合理的流程，有效利用财务报表，保证企业稳定运行并提升服务质量。