是的，免税农产品发票可以抵扣。免税农产品发票是指一般消费者在购买农产品时，经过有关税务机关审核确认可以在增值税普通发票上免征增值税的发票。只要消费者在购买和销售的过程中，均通过官方公认的供应链，将免税发票进行全面申报，即可以申请抵扣税款。抵扣的具体操作方法由企业根据当地税务机关政策来定。 免税农产品发票不仅可以用于增值税抵扣，还可以抵扣其他税收，如消费税、城市维护建设税等。在申请抵扣税款前，企业应当提前准备良好的免税农产品发票，核实其真实性，以便在税务机关的审核中有效通过，效果更佳。 此外，随着我国绿色发展的进程，更多的政策对农产品有贴息、减免等鼓励政策，因此，免税农产品发票抵扣可以使企业获得更多的优惠。