长期零申报增值税存在一定的风险，主要有以下几点： 一是税务机关可能会因为抽查等原因，考查企业是否正确支付相应的增值税，一旦税务机关发现企业未能按照规定申报缴纳相应的增值税，严重者可能会对企业进行处罚，并视情节轻重会按照一定的比例给予处罚。 二是长期零申报增值税可能会对企业的资金积压造成一定的影响，既影响企业的正常资金收入，也影响企业的正常发展。 三是如果企业发现未按规定申报缴纳增值税，会影响企业的信誉，严重者可能对企业的信用造成一定的损害。 四是可能会出现相关税费的滞纳金，影响企业的资金收入。 所以，从事农产品批发行业的企业，如果长期零申报增值税，就要小心其中的风险，谨慎行事，遵守相关法律法规，严格遵守增值税申报及缴纳税收的有关规定。 除此之外，企业还要积极建立完善的增值税报表管理制度，定期对增值税报表进行审计和检查，完善审计机制，不断完善财务管理，提高审计质量，以确保增值税缴纳有效性。