出纳在处理该款项时，要先打印预支款支付凭证，核对金额后，将3000元预支款记入财务系统应付账款账户； 当甲报销2500元支付时，出纳要确认金额准确无误，并将该笔支付款项记入财务系统应付账款账户； 甲再返还500元，出纳还要将其记入财务系统应收账款账户，出款时，要确认500元的凭证，并做好登记。 拓展知识：支付单据是出纳工作中最重要的资料，可以确认本次支付的详细信息，出纳在审核支付单据时，要仔细核对支付信息以及金额，并记录有效凭证，确保财务管理更加规范有序。