是的，可以将单位过磅的磅单作为存根联做账。因为磅单作为单位过磅的凭据，具有单位过磅的相关记载，可以作为存根联做账。 详细而言，将单位过磅的磅单作为存根联做账，要求在磅单上对记载的信息进行完整的记录，包括：过磅时间、过磅数量、过磅重量、过磅人员、负责人签字等，以保证数据准确性和可追溯性，从而能够更好地记录单位过磅并实现财务核算。 拓展知识：磅单不仅可以用于存根联做账，它还可以用于证明交易双方同意对货物数量、重量或质量等条件，从而保护双方的权利。因此，磅单也可以用于争议调解，可极大程度上减少货物争议的发生。