员工借款抵销流水账记录需要将借款人、借款金额、借款日期、借款单据等信息全部记录下来，便于今后对借款金额进行审核核对。此外，抵销的单据也要记录下来，如果抵销的是一笔多个单据的款项，需要细节到每一笔单据，与借款记录编号相关联，以便以后审核核对。 拓展知识：抵销账款时，还需要注意和核对抵销款项与借款款项的金额是否一致，如果不一致，可能存在异常情况发生。此外，记录流水账时还需要注意一些账务报表的格式标准，以方便今后审计，并及时更新相关账务信息，以便获取准确的账务信息，避免因账务信息不准确而引起的后续纠纷。