若发票金额大于付款金额，应当先核实货物数量、价格及税额是否填写正确。若开票的信息存在误差，则需要更改发票上的货物数量、价格及税额，以使发票金额等于付款金额。若发票货物数量、价格及税额填写正确，但发票金额仍大于付款金额，应当妥善处理以免出现双重付款，以免发生财务损失。 一般情况下，专票可以按实际开票税额全部抵扣，但前提是完成了抵税凭证的发放，且发票金额应仍大于付款金额。另外，有些公司会建立一套分步记账模式，当发票金额大于付款金额时，可以申请临时现金支付出账，然后当抵税凭证发放时再把临时现金账户的款项归还到现金账户，这样可以避免双重付款的情况发生。 拓展知识：在结账过程中，如果开票人只收款而不开票，则必须要求该企业给予收据，并进行账务处理，以（一般）50%的税率向税务机关申报，这是为了降低税收负担。