个人独资企业药店的账务处理应该遵循企业会计制度，要求企业账务处理以合法、规范的形式进行，包括会计日记帐、总帐、内部控制等。企业会计制度要求账务处理以下内容： 1、记录财务状况：企业账务处理首先要记录和核算企业财务状况，以便把握财务状况。 2、核算财务收支：企业账务处理不仅要记录财务状况，还要对财务收支情况进行核算，以把握企业的运营状况。 3、分析财务状况：企业账务处理不仅要记录和核算财务状况，还要分析财务状况，以便作出及时的管理决策。 4、实行内部控制：为了保证账务处理的合法性和有效性，企业应该实行适当的内部控制，并定期对其进行有效监控。 拓展知识：账务处理应注重内部控制，及时预测和分析企业财务状况，防止和处理财务欺诈。同时，应完善企业财务管理制度，提高财务管理质量，并相应调整财务会计报表。