首先，公司应按照《公司法》第十三条的规定进行股份变更，即由董事会提出拟变更计划，由股东会表决通过，编制变更后股份配售方案，宣布变更登记期，股东根据计划进行变更登记，其他企业相关主体改组等步骤。 其次，转让股份的一方应向另一方履行约定义务，如公司章程及协议等文件所规定的内容，及应支付转让股份所有人的报酬或补偿，并准备好转让人的股份转让文件，转让文件应包括转让日期、转让股份价格及转让人等条款。 最后，转让人应向公司注册机关提出登记申请，以及向税务机关提出缴纳税费申请，以防止股东变更时纳入税务收入。 总之，公司应按照《公司法》的规定进行股份变更，尊重双方的权利义务，并向有关机关提出登记及税务申请，以保障股份变更顺利完成。 拓展知识：股份转让有关的税费，根据《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税暂行条例》的规定，转让股份所得的税费与转让价格有关，当转让价格高于转让股份市场价格时，应按照有关征收税率扣缴企业所得税。